Mäyräkoirille voi tulla mäyräkoirahalvaus joka on nimestään huolimatta myös mahdollinen muilla koiraroduilla, mutta varsinkin pitkärunkoisilla. Yleisesti tutumpi termi sairaudelle on välilevytyrä. Välilevytyrään sairastuneen koiran välilevymassa on jonkin trauman seuraksena pursunnut selkäydinkanavaan painaen siellä hermoja. Seuraksena voi olla täydellinen tai osittainen takaosan halvaantuminen. Hoitokeinoina käytetään kortisonia, B-vitamiinia, särkylääkkeitä ja täydellistä lepoa. Joskus joudutaan myös turvautumaan selkäleikkaukseen, jossa on omat riskinsä. Sopii aina selkävikojen ilmentyessä pohtia onko mäyriksen vaivat johtuneet liiallisesta syöttämisestä/ylipainosta ja monipuolisen liikunnan puutteesta,vaiko rodun todellisesta herkkyydestä oireille. Mäyräkoirille myös usein esiintyvä tauti, on elefantinihosairaus. Sen seurauksena, koiran kainaloista lähtee karvat, ja siellä on kuin "elefantin ihoa".